Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Prdm6Q3UZD5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm6Q3UZD5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Prdm6Q3UZD5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm6Q3UZD5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm6Q3UZD5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm6Q3UZD5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm6Q3UZD5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm6Q3UZD5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm6Q3UZD5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm6Q3UZD5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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