Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rnpc3Q3UZ01 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnpc3Q3UZ01 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnpc3Q3UZ01 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnpc3Q3UZ01 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnpc3Q3UZ01 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnpc3Q3UZ01 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnpc3Q3UZ01 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnpc3Q3UZ01 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnpc3Q3UZ01 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnpc3Q3UZ01 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnpc3Q3UZ01 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnpc3Q3UZ01 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnpc3Q3UZ01 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnpc3Q3UZ01 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnpc3Q3UZ01 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnpc3Q3UZ01 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnpc3Q3UZ01 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnpc3Q3UZ01 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnpc3Q3UZ01 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnpc3Q3UZ01 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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