Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnaaf3Q3UYV8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnaaf3Q3UYV8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms