Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc160Q3UYG1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms