Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm5aQ3UXZ9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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