Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc114Q3UX62 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms