Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr1d1Q3UV55 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms