Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms