Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap2Q3UND0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms