Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms