Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrch2Q3UMG5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms