Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms