Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gpr55Q3UJF0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms