Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Edc4Q3UJB9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Edc4Q3UJB9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Edc4Q3UJB9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Edc4Q3UJB9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Edc4Q3UJB9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Edc4Q3UJB9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Edc4Q3UJB9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Edc4Q3UJB9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Edc4Q3UJB9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Edc4Q3UJB9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Edc4Q3UJB9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Edc4Q3UJB9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Edc4Q3UJB9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Edc4Q3UJB9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Edc4Q3UJB9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Edc4Q3UJB9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Edc4Q3UJB9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Edc4Q3UJB9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Edc4Q3UJB9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Edc4Q3UJB9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Edc4Q3UJB9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms