Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc34Q3UI66 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc34Q3UI66 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms