Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx6-3Q3UHX8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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