Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK8

Tnrc6a, Trinucleotide repeat-containing gene 6A protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,896 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6aQ3UHK8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnrc6aQ3UHK8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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