Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nom1Q3UFM5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nom1Q3UFM5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nom1Q3UFM5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nom1Q3UFM5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nom1Q3UFM5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nom1Q3UFM5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nom1Q3UFM5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nom1Q3UFM5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nom1Q3UFM5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nom1Q3UFM5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nom1Q3UFM5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nom1Q3UFM5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nom1Q3UFM5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nom1Q3UFM5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nom1Q3UFM5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nom1Q3UFM5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nom1Q3UFM5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nom1Q3UFM5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nom1Q3UFM5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nom1Q3UFM5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nom1Q3UFM5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nom1Q3UFM5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nom1Q3UFM5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nom1Q3UFM5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms