Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Puf60Q3UEB3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Puf60Q3UEB3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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