Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VwceQ3U515 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms