Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klhl21Q3U410 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms