Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud5Q3U2S4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otud5Q3U2S4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms