Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec24aQ3U2P1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms