Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U1D9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U1D9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U1D9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3U1D9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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