Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc174Q3U155 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc174Q3U155 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms