Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms