Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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