Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms