Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt2Q3TTY5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms