Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTL0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTL0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTL0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTL0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTL0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTL0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTL0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTL0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTL0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms