Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc13Q3TIR1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms