Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hddc2Q3SXD3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms