Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb38Q3LR78 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb38Q3LR78 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb38Q3LR78 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb38Q3LR78 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbtb38Q3LR78 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zbtb38Q3LR78 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zbtb38Q3LR78 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zbtb38Q3LR78 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zbtb38Q3LR78 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbtb38Q3LR78 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 361.8 ms