Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR3

Pdss2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss2Q33DR3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdss2Q33DR3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdss2Q33DR3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms