Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M3Q31093 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms