Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
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Shroom4Q1W617 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
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Shroom4Q1W617 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
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Shroom4Q1W617 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
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Shroom4Q1W617 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
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Shroom4Q1W617 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Shroom4Q1W617 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Shroom4Q1W617 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Shroom4Q1W617 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Shroom4Q1W617 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Shroom4Q1W617 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Shroom4Q1W617 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Shroom4Q1W617 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
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Shroom4Q1W617 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Shroom4Q1W617 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Shroom4Q1W617 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Shroom4Q1W617 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Shroom4Q1W617 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Shroom4Q1W617 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Shroom4Q1W617 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Shroom4Q1W617 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms