Protein–RNA interactions for Protein: Q1HCM0

Fgfbp3, Fibroblast growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfbp3Q1HCM0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Fgfbp3Q1HCM0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Fgfbp3Q1HCM0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Fgfbp3Q1HCM0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Fgfbp3Q1HCM0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Fgfbp3Q1HCM0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fgfbp3Q1HCM0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fgfbp3Q1HCM0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Fgfbp3Q1HCM0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Fgfbp3Q1HCM0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgfbp3Q1HCM0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Fgfbp3Q1HCM0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgfbp3Q1HCM0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgfbp3Q1HCM0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgfbp3Q1HCM0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgfbp3Q1HCM0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fgfbp3Q1HCM0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgfbp3Q1HCM0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fgfbp3Q1HCM0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms