Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Myo3bQ1EG27 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms