Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tigd2Q0VBL1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd2Q0VBL1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms