Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc45a4Q0P5V9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc45a4Q0P5V9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms