Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ubxn2bQ0KL01 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn2bQ0KL01 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms