Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Kndc1Q0KK55 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms