Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf541Q0GGX2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf541Q0GGX2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms