Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc7a1Q09143 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms