Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc4Q08624 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms