Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgm3Q08189 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms