Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdf9Q07105 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms