Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah1bQ06985 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms