Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r236Q05A06 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms