Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms